Engenharia química e biológica (research & development)

Componente Laboratorial:
- Desenvolvimento de processos enzimáticos e fermentativos para aproveitamento de resíduos e obtenção de co-produtos.
- Desenvolvimento de bioprocessos para a obtenção de compostos bioativos (funcionais; antimicrobianos; etc.) de interesse para a indústria de alimentos.
- Desenvolvimento de insumos e produtos baseados em processos biotecnológicos para segmentos específicos (nichos de mercado).
- Otimização de bioprocessos e avaliação de microrganismos usados na agroindustrialização de alimentos.

Componente laboratorial: 
- Proporcionar um contacto com as técnicas básicas de microbiologia de modo a potenciar o uso de sistemas biológicos para fazer ou modificar produtos e processos. 
- Dotar os alunos da capacidade de manipularem microrganismos, fazerem a sua caracterização, realizarem crescimentos e utilizarem os microrganismos em aplicações biotecnológicas.

Participação em diferentes projetos na área da sustentabilidade enquanto bolseira de investigação:
- Novo Mar (valorização de produtos e resíduos de cianobactérias)
- SUSCLEAN (análise de superfícies modificadas com vista a evitar a adesão microbiana em indústrias alimentares, garantindo assim qualidade e aumento de tempo de prateleira dos produtos).

Enquanto investigadora de Doutoramento de Engenharia Química e Biológica (ramo de Engenharia Biomédica):
- desenvolvimento de um sistema que mimetiza fluidos do corpo humano com vista a prevenir/controlar infeções bacterianas. Para isso, várias colaborações com grupos internacionais foram necessárias a fim de testar diferentes superfícies com capacidade antifouling, evitando desta forma a adesão/formação de biofilme e possíveis infeções.

Publications:
Romeu MJ, Alves P, Morais J, Miranda JM, de Jong E.D. Sjollema J, Ramos V, Vasconcelos V, Mergulhão F.J (2019) Biofilm formation behaviour of marine filamentous cyanobacterial strains in controlled hydrodynamic conditions, Environmental microbiology.

Alves P, Nir S., Reches M, & Mergulhão F (2018) The effects of fluid composition and shear conditions on bacterial adhesion to an antifouling peptide-coated surface. MRS Communications,1-9. doi:10.1557/mrc.2018.160.

Lopez-Mila B, Alves P, Riedel T, Dittrich B, Mergulhao F, Rodriguez-Emmenegger C (2018) Effect of shear stress on the reduction of bacterial adhesion to antifouling polymers. Bioinspir Biomim. doi: 10.1088/1748-3190/aadcc2.

Moreira J, Fulgêncio R, Alves P, Machado I, Bialuch I, Melo L, Simões M, Mergulhão FJ (2016) Evaluation of SICAN performance for biofou-ling mitigation in the food industry. Food Control, 62:201-7.

BOOK CHAPTER:
M. J. Romeu, P. Alves, J. Morais, V. Ramos, V. Vasconcelos, and F. J. Mergulhão (2016) Biofilm FormatIon by a Cyanobaterium Strain Be-longing to a Distinct Leptolyngbya phylotype: Surface Effect. In Judith Henderson editors. Biofilms: characterization, Applications and Recent Advances. Nova Science Publishers, Inc. Chapter 5 pp. 153-174. ISBN: 978-1-53610-138-6.

OTHER PUBLICATIONS (ABSTRACTS IN INTERNATIONAL CONFERENCES):
Alves P, Mergulhão F (2019) Effect of shear stress on the reduction of bacterial adhesion to antifouling polymers, 14th International Trien-nial Conference on the Science and Technology of Adhesion and Adhesives (Adhesion'19), Bristol, United Kingdom, September 3-5th 2019;

Alves P, Lopez-Mila B, Riedel T, Dittrich B, Rodriguez-Emmenegger C, Mergulhão F (2019) Effect of shear stress on the reduction of bacterial adhesion to antifouling polymers, COST AMiCI Meeting, Riga, Latvia, 7 March 2019;

Romeu MJ, Alves P, Morais J, Ramos V, Vasconcelos V, Mergulhão FJ (2017) Biofilm formation by cyanobacterium Leptolyngbya mycoidea LEGE 06118: surface effect, in 2nd Doctoral Congress of Engineering 2017 (DCE17), Porto, Portugal, 8-9 June 2017;

Alves P, Moreira JMR and Mergulhão FJ (2017) Evaluation of bacterial adhesion to biomedical surfaces in controlled hydrodynamic condi-tions, in 2nd Doctoral Congress of Engineering 2017 (DCE17), Porto, Portugal, 8-9 June 2017;

Moreira JMR, Alves P, Fulgêncio R, Oliveira F, Machado I, Bialuch I, Melo LF, Simões M, Mergulhão FJ (2016) Evaluation of SICAN and SICON® surfaces for biofouling mitigation in the food industry, in Biofilms7, Porto, Portugal, 26-28 June 2016;

Romeu, MJ, Alves P, Morais J, Vasconcelos V, Mergulhão FJ (2016) Biofilm formation by Leptolyngbya mycoidea LEGE 06118: surface effect, in Biofilms7, Porto, Portugal, 26-28 June 2016.

ORAL PRESENTATIONS
Alves P, Mergulhão F (2019), Performance assessment of antifouling peptide coating for reducing bacterial attachment using a parallel plate flow cell, in DeLNAM workshop, from 16th to 20th November 2019, Ghent, Belgium;

Alves P, Mergulhão F (2019), Antifouling surfaces for medical and industrial applications, in FEUP, 12th June 2019, Porto, Portugal;

Alves P, Mergulhão F (2019), Evaluation of Escherichia coli biofilms in controlled hydrodynamic conditions using flow cells, in SCELSE course, Nanyang Technological University campus from 25th June 2019 to 12th July 2019, Singapore;

Alves P, Lopez-Mila B, Riedel T, Dittrich B, Rodriguez-Emmenegger C, Mergulhão F (2019), Effect of shear stress on the reduction of bacte-rial adhesion to antifouling polymers, in COST AMiCI Meeting, 7th March 2019, Riga, Latvia;

Alves P, Mergulhão F (2015), Evaluation of Bacterial Adhesion to Biomedical Surfaces in Controlled Hydrodynamic Conditions, in iPROME-DAI Summer School 2015 “Antimicrobial Medical device”, from 9th to 16th September 2015; Amsterdam, Netherlands.

Project: Characterization of bacterial biofilms at the structural and molecular level

Publication: 
Alves P, Al-Badi E, Withycombe C, Jones PM, Purdy K, Maddocks SE (2018) Interaction between Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa is beneficial for colonisation and pathogenicity in a mixed-biofilm. Pathogens and Disease, doi: 10.1093/femspd/fty003.

Project: “The role of Gardnerella vaginalis biofilms in the occurrence of mixed biofilms in the case of Bacterial Vaginosis”

Publications:
Castro J, Alves P, Sousa C, Cereija T, França Â, Jefferson KK, Cerca N (2015) Using an in-vitro biofilm model to assess the virulence potential of Bacterial Vaginosis or non-Bacterial Vaginosis Gardnerella vaginalis isolates. Sci. Rep. 5, doi: 10.1038/srep11640.

Alves P, Castro J, Sousa C, Cereija T, Cerca N (2014) Gardnerella vaginalis outcompetes 29 other bacterial species isolated from BV patients in an in vitro biofilm formation model. Journal of Infectious Diseases, doi: 10.1093/infdis/jiu131.

Cereija T, Castro J, Alves P, Cerca N (2013) Influence of anaerobic conditions on vaginal microbiome recovery from Bacterial Vaginosis patients. Sexually Transmitted Infections, 89:307, doi: 10.1136/sextrans-2013-051100.

Sendo a Bioengenharia uma área que tem tido extraordinários avanços científicos (em Eng de Proteínas, Biologia de Células Estaminais, Biologia de Sistemas, Biologia Sintética, Genómica, Bioinformática e Nanobiotecnologia) torna-se imperativa a formação avançada de especialistas com capacidade de traduzir os avanços científicos e tecnológicos nesta área para o sector produtivo num ambiente sustentável da humanidade e melhoria da sua qualidade de vida. Neste sentido, o Mestrado em Bioengenharia destina-se à formação avançada de Licenciados de modo a desenvolver a capacidade de abordagem multidisciplinar de problemas de Biotecnologia e de Biomedicina.

A formação em Bioengenharia tem uma elevada componente prática e laboratorial cobrindo variados tópicos da Bioengenharia e é da responsabilidade do Departamento de Engenharia Biológica (DEB) que tem elevada reputação nacional e internacional ao nível da investigação em Bioengenharia bem como da ligação ao tecido empresarial Português.

O perfil do programa de estudos compreende o desenvolvimento do conhecimento técnico-científico e do saber de natureza profissional nas áreas de estudos de biologia e bioengenharia oferecendo uma sólida formação multidisciplinar em melhoramento animal e vegetal, microbiologia aplicada, biorremediação e desenvolvimento de novos produtos e serviços para os setores agro-alimentar, ambiental, biomédico, farmacêutico e cosmético.